時差也是一個常見的惱人問題，它往往使人到了目的地后頭痛、昏昏欲睡、注意力無法集中，甚至免疫力降低，易引發病毒或細菌感染。

這一方面是因飛越時區，打亂了生理時鐘所造成；另一方面是機艙的艙壓比正常環境低，空氣又比較稀薄、干燥，造成生理上的不舒服。

針對生理時鐘的調整，最好在出發前三天就開始。往東飛就每晚早睡一小時，往西飛則相反。

出發前幾天要保持適度的運動量，睡眠一定要充足，飲食以淀粉類、碳水化合物及蔬菜為主。在飛機上可用耳塞、眼罩、頭枕來幫助睡眠。

攜帶幼兒出門的家長，則不必擔心三歲以下孩子生理時鐘的問題，因為他們的生理調節機制尚未固定，反而比大人還有彈性。