凡是提到雌激素和激素替代治療，人們都會不約而同地問：會增加得癌的危險嗎?這個疑問在廣泛推行激素替代治療的今天，顯得格外引人注目。?
    爭議最大的當數。乳腺癌的危險因素包括家族史、初潮提前和絕經較晚、30歲以后初次妊娠等。科學家進行了一次又一次大規模的學調查，有人把多項研究的所有數據匯總起來，進行詳細分析。研究結果認為，連續五年以上的激素替代治療使患乳腺癌的危險僅輕度增加，并隨用藥時間的延長，危險性仍有緩慢增加的趨勢。另外一些研究表明，激素替代治療并未增加乳腺癌的危險性。沒有證據表明，有乳腺癌家族史的婦女接受激素替代治療會增加乳腺癌發生，但仍應持謹慎態度。? 
    目前公認的觀點是，有乳腺癌病史的婦女，應禁用雌激素替代治療；有乳腺癌家族史的婦女，應慎用雌激素替代治療。因為乳腺是雌激素的敏感器官，雌激素可促進乳腺癌病灶的生長 ，使乳腺癌復發率增加、復發時間縮短、生存率下降。需要強調的是，接受替代治療出現的脹痛并非乳腺癌征兆，而可能是乳腺充血所致，通常經過六個月的適應或調整用藥方案即可緩解，不必多慮。
    子宮內膜也是雌激素的靶器官。單純的雌激素替代治療會增加患的危險，即使是小劑量也會增加患子宮內膜癌的危險性。而孕激素對子宮內膜的保護作用已眾所周知。已施行子宮全切術的婦女在接受替代治療時不必服用孕激素。未行子宮切除術的婦女，在接受替代治療時，一定不要嫌加用孕激素麻煩、費事，因為孕激素是子宮內膜的忠實衛士；在孕激素參與替代治療后，患子宮內膜癌的幾率與不用替代治療的的幾率幾乎一致。?
　　迄今為止，沒有證據表明激素替代治療與其他腫瘤有關。國外的資料還表明，激素替代治療明顯改善了上皮性病人的生活質量，而且未縮短他們的生存時間。國外的研究還發現，激素替代治療使婦女患和的危險降低。